La formation en micropsychanalyse correspond à un Master de niveau II. Elle prévoit que tous les candidats soient titulaires d'un diplôme de psychologie et/ou de médecine et aient commencé ou terminé une spécialisation en psychothérapie reconnue par leur pays de résidence. Pour suivre une formation micropsychanalytique complète, il est nécessaire de se soumettre à une analyse personnelle, complétée par des séances de supervision individuelles et de groupe. Le candidat doit adresser sa demande à la Commission de la Pratique de l'ISM, qui lui fournira la liste des analystes habilités à la fonction de formation les plus proches de son lieu de résidence et parlant sa langue maternelle. Avec l'analyste désigné, le candidat suivra son analyse personnelle. Les séances de supervision individuelles seront de préférence menées par un analyste différent (sauf en cas de problèmes de langue), tandis que les séances de groupe se dérouleront en ligne avec tous les analystes de l'ISM habilités à la fonction de formation et avec des collègues d'autres écoles psychanalytiques qui collaborent avec l'ISM. Une fois l'analyse personnelle commencée, le candidat peut devenir membre candidat de l'Institut Suisse de Micropyschoanalyse. Il s'engage ensuite à participer à des séminaires, des cours, des journées d'étude ou des congrès dans le domaine de la micropsychanalyse, de la psychanalyse, de la psychothérapie et des disciplines connexes. Tous les deux ans à partir du début de son analyse personnelle, le candidat présente à la Commission de la pratique un mémorandum sur l'évolution de son analyse. Une fois l'analyse personnelle terminée, le candidat sera habilité à exercer la micropyschoanalyse, sous la supervision d'un analyste superviseur. Pour devenir membre titulaire, il devra s'écouler au moins deux ans après l'obtention du titre de membre habilité. Lemicropsychanalyste devra présenter à la Commission de la pratique une liste de ses publications et un rapport écrit de son analyste superviseur confirmant l'achèvement de la formation. Pour devenir analyste habilité à la fonction de formation, il faut être membre titulaire depuis au moins 5 ans, avoir contribué à la diffusion et à la formation micropsychanalytique par le biais de cours de formation, de publications et de contributions scientifiques à des séminaires et des colloques. Le micropsychanalyste devra adresser une demande écrite à la Commission de la pratique qui vérifiera si les documents présentés reflètent une connaissance approfondie de la psychanalyse et de la pratique micropyschoanalytique. En cas  connaissances théoriques et techniques.